AMD разполага с разнообразие от чипсети и техните варианти в портфолиото си. На практика някои дънни платки са проектирани да поддържат по-широк спектър от PCIe стандарти, отколкото показват официалните им спецификации. Например базираните на B650 дънни платки често имат същата хардуерна конфигурация като моделите, базирани на B650E. Това означава, че те са технически способни да поддържат PCIe 5.0, въпреки че самият чипсет B650 не гарантира официално тази възможност.

Подобни предположения бяха неволно потвърдени и от Gigabyte. Потребителите съобщиха, че техните B650 базирани дънни платки без индекс „E“, официално анонсирани за съвместими само с PCIe 4.0, всъщност осигуряват и пълна функционалност с PCIe 5.0 устройствата. Това беше потвърдено, по-специално, при свързване на видеокартите от ново поколение с поддръжка на PCIe 5.0.

Въпреки това, с пускането на актуализацията на BIOS във версия 1203E, Gigabyte деактивира възможността тези платки да работят с PCIe 5.0, ограничавайки ги до поддръжката само на PCIe 4.0. AMD не е обявила официално наличието на поддръжка за PCIe 5.0 в платките, базирани на B650, и Gigabyte очевидно не е имала убедителна причина да блокира достъпа до тази функция — особено след като потребителите сами са могли да се върнат към PCIe 4.0, ако е необходимо. Причината вероятно е била самата имплементация: поддръжката на PCIe 5.0 е била активирана по подразбиране и не е била маркирана като експериментална по никакъв начин, което може би не е харесало на AMD.

За собствениците на повечето видеокарти този инцидент едва ли ще е сериозен проблем — разликата в производителността между PCIe 4.0 и PCIe 5.0 обикновено е минимална. При бюджетните модели обаче въздействието може да е по-забележимо. Така, според един от авторите на рецензиите, при превключване на Nvidia GeForce RTX 5060 Ti с 8 GB памет в режим PCIe 4.0, производителността намалява с около 10%. Това се дължи както на по-малкия брой линии на самата видеокарта, така и на намалената пропускателна способност, което има забележим негативен ефект.